Dans cet épisode, nous retraçons 60 ans d'histoire et d'innovations qui ont façonné la découverte de médicaments grâce à l'informatique et à l'intelligence artificielle. Des premières équations sur papier de Corwin Hansch et Toshio Fujita en 1964 aux découvertes récompensées par le prix Nobel de chimie en 2024, nous explorons comment les chercheurs ont appris à transformer les molécules en données exploitables par des ordinateurs. À travers les grandes étapes du docking moléculaire, de l'émergence du deep learning, des modèles génératifs et des avancées d'AlphaFold, cet épisode met en lumière la transition entre le simple tri de catalogues chimiques et la création sur mesure de nouvelles molécules à visée thérapeutique.

Sujets abordés :

• L'origine de la relation quantitative structure-activité (QSAR) et les travaux pionniers de Hansch et Fujita en 1964.

• Le système expert DENDRAL à Stanford et les débuts du raisonnement chimique automatisé.

• La conception du Captopril et l'évolution du modèle clé-serrure vers l'ajustement induit (main-dans-le-gant).

• La naissance du docking moléculaire avec le logiciel DOCK à l'UCSF et l'exemple des inhibiteurs de la protéase du VIH.

• La crise de productivité de la recherche pharmaceutique illustrée par la loi d'Eroom.

• Le tournant du deep learning : le challenge Merck Kaggle de 2012 et l'arrivée des réseaux de neurones profonds.

• Le passage du filtrage à la génération de novo de molécules via l'apprentissage par renforcement (AtomNet, REINVENT, ReLeaSE, GENTRL).

• L'entrée en essais cliniques des premières molécules conçues par IA (DSP-1181) et le problème du repliement des protéines résolu par AlphaFold.

• La conception de protéines synthétiques avec RFdiffusion et le prix Nobel de chimie 2024.

• Le premier signal clinique significatif en Phase 2a pour une molécule identifiée par IA (le rentosertib d'Insilico Medicine).

Crédit :

Production : MedShake Studio

Animation : Anca Petre

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